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这是很多人疑惑的一个地方，毕竟参考文献太容易重复了。 答案是： 知网查重对象不包括参考文献，但你也不需要将参考文献从论文中删除。 以知网查重来说，可以肯定的是：查重对象是不包括参考文献的。 而且，就算你没有将参考文献从论文中删除，知网也是能正常识别出来参考文献部分的，前提是你的论文结构是规范的，而且按照 规范格式 引用了参考文献。 简单来说，按照学校要求的大纲架构和参考文献引用规范（GB/T-7714）去写论文，知网都能识别出参考文献部分，并在查重时自动剔除。 不仅是参考文献部分，诸如论文封面、目录、成果清单等内容也是不在查重范围内的。 而且，在查重报告中， 不纳入查重范围的参考文献、目录等内容都会以灰色字体显示，而正文则以黑色字体显示。
封面、摘要、绪论、第一章、第二章、等等这样一系列的都会各自分成一个片段来检测，每一个片段都计算出一个相似度，再通过这样每章的相似度来计算出整篇论文的总重复率。 当知网查重系统识别到你论文中有某句话涉嫌抄袭的时候，它就会对这句话的前面后面部分都重点进行模糊识别，这个时候判断标准就变得更严格，仅仅加一些副词或虚词 (比如“的”、“然后”、“但是”、“所以”此类词语）是能够识别出来的。 在知网查重进行中，检测系统只能识别文字部分，论文中的图片、word域代码、mathtype编辑的公式、是不检测的，因为检测系统尚无法识别这些复杂的内容格式。
但是像我所在的浙江大学，学校为学生购买了知网查重服务，并集成到研究生管理系统了，而且， 用于查重的论文版本也是最终送审的版本 。 这意味着，删除参考文献是不可取的，因为送审版本是需要包括参考文献的。